Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vil1Q62468 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms