Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Trpc1Q61056 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Trpc1Q61056 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc1Q61056 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Trpc1Q61056 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc1Q61056 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc1Q61056 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc1Q61056 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc1Q61056 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc1Q61056 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc1Q61056 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc1Q61056 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc1Q61056 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc1Q61056 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc1Q61056 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc1Q61056 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc1Q61056 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc1Q61056 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc1Q61056 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc1Q61056 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc1Q61056 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc1Q61056 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc1Q61056 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc1Q61056 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc1Q61056 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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