Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms