Protein–RNA interactions for Protein: Q5SU73

Coil, Coilin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoilQ5SU73 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CoilQ5SU73 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CoilQ5SU73 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms