Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav8d-2Q5R1B6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms