Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms