Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Defa20Q45VN2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Defa20Q45VN2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Defa20Q45VN2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Defa20Q45VN2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Defa20Q45VN2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Defa20Q45VN2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Defa20Q45VN2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Defa20Q45VN2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Defa20Q45VN2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Defa20Q45VN2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Defa20Q45VN2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Defa20Q45VN2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Defa20Q45VN2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Defa20Q45VN2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Defa20Q45VN2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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