Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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