Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms