Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms