Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc69Q3TCJ8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms