Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Riiad1Q3KNY5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riiad1Q3KNY5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms