Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWQ2

Nell1, Protein kinase C-binding protein NELL1, mousemouse

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Length 810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell1Q2VWQ2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms