Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBB0

Prelid2, PRELI domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid2Q0VBB0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prelid2Q0VBB0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prelid2Q0VBB0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms