Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Cnn1Q08091 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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