Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aplp2Q06335 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms