Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc2Q05020 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms