Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms