Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smarcad1Q04692 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms