Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms