Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms