Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms