Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43bP86448 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43bP86448 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms