Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcbP68404 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcbP68404 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms