Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d3P61079 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d3P61079 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms