Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd5P56812 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms