Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

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Length 146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CdaP56389 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CdaP56389 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CdaP56389 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CdaP56389 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CdaP56389 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CdaP56389 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CdaP56389 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CdaP56389 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CdaP56389 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CdaP56389 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CdaP56389 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CdaP56389 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CdaP56389 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CdaP56389 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CdaP56389 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CdaP56389 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CdaP56389 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CdaP56389 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CdaP56389 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CdaP56389 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CdaP56389 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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