Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh5P55284 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms