Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PltpP55065 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PltpP55065 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PltpP55065 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PltpP55065 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PltpP55065 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PltpP55065 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms