Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TspoP50637 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TspoP50637 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TspoP50637 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TspoP50637 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TspoP50637 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TspoP50637 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TspoP50637 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TspoP50637 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TspoP50637 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TspoP50637 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TspoP50637 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TspoP50637 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TspoP50637 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TspoP50637 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TspoP50637 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TspoP50637 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TspoP50637 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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TspoP50637 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TspoP50637 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TspoP50637 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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