Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CratP47934 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CratP47934 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CratP47934 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CratP47934 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CratP47934 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CratP47934 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CratP47934 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CratP47934 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CratP47934 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CratP47934 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CratP47934 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CratP47934 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CratP47934 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CratP47934 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CratP47934 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CratP47934 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CratP47934 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CratP47934 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CratP47934 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CratP47934 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms