Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pik3caP42337 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pik3caP42337 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms