Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tac1P41539 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tac1P41539 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms