Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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