Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpargP37238 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpargP37238 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PpargP37238 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms