Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rfc1P35601 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms