Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms