Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms