Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms