Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl13aP19253 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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