Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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