Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms