Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myf6P15375 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Myf6P15375 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms