Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb2P13373 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms