Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fv4P11370 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms