Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl2P10148 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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