Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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