Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01729 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01729 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01729 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01729 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01729 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01729 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01729 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01729 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01729 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01729 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01729 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01729 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01729 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01729 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01729 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01729 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01729 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms