Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8O89110 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casp8O89110 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms