Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg2O55111 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms